El nuevo PubMed y sus relaciones con los principales gestores bibliográficos…

5 mayo, 2020

PubmedYa sabemos todos que el nuevo PubMed, simplemente PubMed a partir del 18 de mayo,  está resultando controvertido, sobre todo entre los profesionales de las bibliotecas y documentación, porque en cambio, seguramente, para los usuarios, va a resultar un interfaz más amigable, más a-lo-Google… Otros blogs (María Gª-Puente, Concepción Campos, BiblioMadSalud, Saludteca…) ya han expuesto sus experiencias con esta base de datos que, por otro lado, nos guste o no, forma parte de nuestro día a día y necesitamos conocer a la perfección (para sacarle el máximo partido en nuestras búsquedas, para formar a nuestros usuarios, etc.). En este post nos vamos a centrar en una cuestión concreta: la exportación de referencias a algunos de los principales gestores bibliográficos que tenemos accesibles en nuestra biblioteca: Zotero, Mendeley, EndNote vía WoS, y Rayyan. Una vez superado el susto de que quitaran la posibilidad de exportar canales RSS, otra cuestión importante, en cuanto a la exportación  y actualización de resultados, era la relación con los gestores bibliográficos.

Cite PubMed

Todo se simplifica en el nuevo PubMed pero ¿se pierden demasiados matices en aras de la amigabilidad? por ejemplo, la posibilidad de conseguir la cita rápidamente en distintos formatos resulta muy cómoda para elaborar una bibliografía rápidamente pero no su inserción como citas en un texto… (por otro lado, esta opción ya existía : formato Summary Text de la versión antigua, que ahora implica descargar un fichero). La ventaja de un gestor es que nos permite mantener nuestra base de datos propia de referencias que nos interesan (alimentada desde distintas bases de datos, no solo PubMed) y su posterior utilización para citarlas en la redacción de textos. Los gestores, en general, van a capturar sin problema el fichero que exportemos desde PubMed (en formato Citation Manager desde Send to o PubMed desde Save).

Save SentTo PubMed

Zotero o Mendeley, por citar algunos, han desarrollado además conectores o plugins que se integran en el navegador y, de una forma rápida, capturan las referencias que tengamos en pantalla, en esto sí que todavía faltan ajustes…

Zotero

Para importar un fichero de referencias de PubMed a Zotero no hay más que utilizar el botón Save y guardarlo en formato PubMed (se genera un fichero .txt con etiquetas RIS más algunas propias de PubMed) o el botón Send to y guardarlo en formato Citation Manager (fichero .nbib), luego, en Zotero,  acceder a Archivo/Importar. Sin embargo, lo más cómodo cuando se utiliza Zotero como gestor es la posibilidad de capturar referencias desde cualquier web o base de datos con el Zotero Connector, pues bien, con las referencias de una en una funciona sin problema pero, con la famosa carpetita amarilla (captura de las referencias que tengamos en pantalla), parece que hay algún problema de tipo técnico todavía pendiente de resolver con la NLM, esperemos que en breve se recupere esta posibilidad

mendeley_logo_verticalMendeley importa .nbib y formato PubMed sin problema arrastrando los archivos descargados a la zona central de Mendeley. Sí funciona el complemento Mendeley Web Importer en Chrome, Firefox y Explorer. Os recordamos que, a través de la suscripción que la Biblioteca Virtual de la Consejería de Sanidad de Madrid, tenemos acceso al Mendeley institucional con las consiguientes ventajas… 

EndNote está disponible a través de la aportación de la Biblioteca Virtual de la Consejería de Sanidad de Madrid (FECYT coordina la suscripción nacional). Este gestor bibliográfico importa también sin EndNoteproblema en formato PubMed y Citation Manager (seleccionar en ambos casos, como Import option del desplegable, PubMed NLM). Al igual que Zotero, el complemento Capture reference solo funciona con referencias individuales, no captura una lista de resultados…

RayyanPor último, un breve comentario sobre Rayyan, un gestor específicamente orientado a revisiones sistemáticas. No dispone de complemento para captura directa sino que siempre hay que descargar el fichero con las referencias y luego subirlo a Rayyan. Ese fichero, desde el nuevo PubMed, deberá ser en formato CSV (y con muy pocos metadatos útiles, la verdad), esperemos que desarrollen también la adaptación para que sean importables los formatos PubMed y Citation Manager como en el resto de gestores.

Toda la información suministrada, como podéis comprobar, está sujeta a cambios que probablemente mejorarán las posibilidades y la integración de todos los gestores con PubMed, pero a día de hoy la situación es esta…


Las #BiblioSesiones y cursos de la Biblioteca del Hospital Universitario de Fuenlabrada

7 octubre, 2019

efylvnoxsaure1mPara terminar el año, desde la Biblioteca HUF hemos organizado un trimestre con mucha formación. Además de nuestras habituales #BiblioSesiones (tercer viernes de cada mes a las 8:00 h.), se ofrecen varios cursos cortos sobre diversos temas relacionados con las fuentes y la búsqueda de información.

En octubre tenemos programada una bibliosesión sobre Mendeley (día 18, a las 8:00 h., en el aula 6, la de ordenadores). Vendrá Patricia Zevallos, de Elsevier, para hablarnos de este gestor bibliográfico, incorporado este año a la licencia de compra que la Consejería de Sanidad mantiene con la empresa Elsevier (Clinical Key, Embase, Fisterra, etc.). A las habituales prestaciones de los gestores bibliográficos como Zotero o EndNote, Mendeley suma una gran potencialidad en las redes sociales y almétricas. Os esperamos, ya sabéis que para las #BiblioSesiones no hace falta inscripción.

Además en octubre, y en horario de tarde (15:30 h., en el aula 6), se han organizado los mini cursos: Búsqueda de información en bases de datos bibliográficas. Pubmed, Embase, Dialnet, Apoyo a la práctica asistencial, investigadora y docente de la biblioteca HUF, Dónde y cómo buscar información y organizar lo encontrado en la era de Internet dentro de la oferta de cursos de formación continuada de la Dirección de RRHH del HUF.

Para noviembre, la bibliosesión está organizada para el día 15 (a las 8:00 h. en el aula 6). Recibiremos al director de Cochrane Madrid, Jesús López Alcalde, que nos hablará del nuevo centro, de posibilidades de participar en grupos, de cómo publicar revisiones sistemáticas Cochrane, etc.

En cuanto a cursos, por la tarde, en noviembre ofrecemos: Gestión de referencias bibliográficas: Zotero, Impacto y posicionamiento en el ámbito científico: Métricas, Dónde publicar y cómo: Identidad científica y selección de la revista adecuada.


Acceso institucional a @Mendeley a través de la Biblioteca Virtual de la Consejería de Sanidad de la Comunidad de Madrid

5 julio, 2019

Mendeley es una herramienta de Elsevier que empezó siendo un gestor bibliográfico al estilo de Zotero, RefWorks o EndNote, pero que ha ido ampliando sus funcionalidades (red social con reflejo en altmetrics, ofertas de empleo, repositorio de datos, financiación de investigación, etc.). Mantiene un acceso gratuito pero ofrece la opción de mejorar el servicio, tanto por suscripción individual como institucional y, tal y como ya se os adelantaba hace unos días en este blog, la Consejería de Sanidad, al renovar el contrato de adquisición de las licencias de acceso y uso de productos electrónicos de información científica (plataformas, revistas electrónicas y bases de datos) del editor Elsevier para la Biblioteca Virtual de la Consejería de Sanidad de la Comunidad de Madrid, ha incluido la suscripción oficial de Mendeley Institucional.

Desde ya es posible darse de alta o, en caso de tener perfil de la versión libre, adherirse al acceso institucional (al entrar desde cualquier ordenador del HUF o desde la web de la Biblioteca HUF, se actualizará el perfil y se recibirá un correo informando de que al formar parte de una organización con suscripción a Mendeley Institutional Edition la cuenta será actualizada).

¿Y qué implica el acceso institucional a Mendeley frente al gratuito? pues pasar de 2 Gb de almacenamiento personal a 100 Gb, de 100 Mb de almacenamiento compartido a 100 Gb, de poder tener como mucho 5 grupos con 25 colaboradores a todos los grupos que se quiera con hasta 100 colaboradores…

Automáticamente vais a ver que se os incluye en el grupo Consejería de Sanidad de Madrid – Biblioteca Virtual donde además podréis interactuar con el resto de profesionales del sistema madrileño de salud que estén presentes en Mendeley (que tiene un fuerte componente de red social).

Desde la Biblioteca HUF organizaremos formación sobre el recurso pero mientras tanto os dejamos recursos informativos de diferentes universidades que tienen publicadas en sus webs información útil y guías de uso:


Cómo redactar y gestionar referencias bibliográficas en ciencias de la salud #Zotero #Mendeley

3 abril, 2018

Con una duración de tres tardes, se va a impartir en nuestro hospital un curso de gran interés para sus profesionales, especialmente para aquellos que investigan, publican, etc. Bajo el título Cómo redactar y gestionar referencias bibliográficas en ciencias de la salud haremos un recorrido, muy práctico, sobre el arte de citar y referenciar y conoceremos los dos softwares libres más extendidos en la actualidad: Zotero y Mendeley.

El cronograma del curso es 8, 10 y 16 de mayo de 2018, de 15:30 a 19:30 h., en el Aula 6 del HUF. Todos los alumnos (el curso está abierto a profesionales de otros centros de la Consejería de Sanidad, aunque tendrán prioridad los del HUF) dispondrán de ordenador para poner en práctica lo aprendido que, detallado en formato programa, será:

  1. Introducción a la gestión de las referencias bibliográficas. Estilo Vancouver
  2. Introducción al gestor bibliográfico Zotero. Gestión de referencias y elaboración de bibliografías con Zotero
  3. Introducción al gestor bibliográfico Mendeley. Gestión de referencias y elaboración de bibliografías con Mendeley

Para impartirlo contamos con tres profesionales de bibliotecas de salud de Madrid: José Manuel Estrada (Hospital Universitario Doce de Octubre), Oliver Martín (Universidad Complutense de Madrid) y Juan Medino (Hospital Universitario de Fuenlabrada).


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